باسابقه‌ترین سازمان مردم‌نهاد در کشورمان با قدمت 55 سال، سازمان نظام پزشکی است.

این سازمان با تصویب مجلس شورای ملی سابق در سال 1338 تشکیل گردید و در سال 1348 با تصویب مجلس آن زمان؛ کلیه فارغ‌التحصیلان جامعه پزشکی موظف به عضویت و دریافت کارت از آن سازمان گردیدند و ازآن‌پس بدون کارت نظام پزشکی و شماره نظام پزشکی طبابت میسر نبود.

در آن دوران، مسئولین سازمان نظام پزشکی به‌صورت انتصابی در این مسئولیت قرار می‌گرفتند و این روند حدود یک دهه پس از پیروزی انقلاب شکوهمند اسلامی ایران ادامه یافت، در اصفهان نیز اوایل انقلاب امور سازمان به معتمد جامعه پزشکی اصفهان؛ دکتر محمدعلی ابوترابی محول گردید.

فعالیت‌های سازمان با همکاری تعدادی از پزشکان و با حداقل امکانات در یک اتاق عاریه‌ای در تأمین اجتماعی و سپس با نقل‌مکان به دو اتاق در معاونت درمان دانشگاه و پس‌ازآن در یک ساختمان استیجاری پی گرفته می‌شد تا اینکه در سال 1369 با تصویب قانون نظام پزشکی در مجلس شورای اسلامی اولین انتخابات آزاد هیئت‌مدیره‌های سازمان در کشور و به‌تبع آن در اصفهان صورت پذیرفت و در ادامه با تغییرات قوانین نظام پزشکی در سنوات مختلف در مجلس شورای اسلامی تاکنون به کار خود ادامه داده است.

شایان‌ذکر است از ابتدای انقلاب اسلامی جمعی از پیشکسوتان جامعه پزشکی اصفهان به دنبال تهیه و تدارک زمین و ساختمان و امکانات برای سازمان بودند تا اینکه در بهمن‌ماه 1374 با مساعدت استاندار وقت؛ مهندس اسحاق جهانگیری و تلاش جامعه پزشکی اصفهان به‌ویژه پیگیری‌های برخی پیشکسوتان ازجمله شادروان دکتر عبدالرضا توکلی، دکتر منصور شریفی، دکتر محمدحسن رهگذر، دکتر محمدابراهیم اردستانی و دکتر حسن مؤمنی کلنگ ساخت خانه پزشک بر روی زمینی که به نام سازمان نظام پزشکی اصفهان با قیمت مناسب خریداری‌شده بود، آغاز گردید.

به‌منظور تأمین هزینه مربوطه و ساخت‌وساز، مبادرت به تشکیل تعاونی مصرف درمانگران تحت نام خانه پزشک گردید و با مشارکت 2580 عضو از جامعه پزشکی و پرداخت حق سهام ساختمان با بهترین وجه ساخته و تکمیل شد و در روز یکم شهریور سال 1378 مصادف با روز پزشک با حضور مسئولین کشوری و استانی مورد بهره‌برداری قرار گرفت.

در حال حاضر کلیه فعالیت‌های سازمان نظام پزشکی، تعاونی مصرف درمانگران، انجمن‌های علمی گروه پزشکی اصفهان، دادسرای انتظامی، هیئت‌های بدوی انتظامی، هیئت تجدیدنظر انتظامی و آموزش‌های مدون و مداوم جامعه پزشکی و صدور پروانه پزشکی در این ساختمان متمرکز می‌باشد.